ATAC-Seq技術(shù)的原理是通過轉(zhuǎn)座酶Tn5容易結(jié)合在開放染色質(zhì)的特性，然后對Tn5酶捕獲到的DNA序列進(jìn)行測序。DNA轉(zhuǎn)座，是一種把DNA序列從染色體的一個區(qū)域搬運到另外一個區(qū)域的現(xiàn)象，由DNA轉(zhuǎn)座酶來實現(xiàn)。這種轉(zhuǎn)座插入DNA，也是需要插入位點的染色質(zhì)是開放的，否則就會被高級結(jié)構(gòu)給卡住。
轉(zhuǎn)座酶可以隨機(jī)結(jié)合并切割染色質(zhì)開放區(qū)的DNA，并且可同時在切割位點插入接頭序列。如下圖，只要將攜帶已知DNA序列標(biāo)簽的轉(zhuǎn)座復(fù)合物（即帶紅色和藍(lán)色序列標(biāo)簽的Tn5轉(zhuǎn)座酶）加入到細(xì)胞核中一起孵育，再利用已知序列標(biāo)簽進(jìn)行PCR擴(kuò)增即可形成文庫，經(jīng)過測序就可以獲得染色質(zhì)開放區(qū)的信息。
1、靈敏度高,細(xì)胞起始量低；
2、操作更簡單，優(yōu)化建庫、耗時短；
3、技術(shù)重復(fù)性強(qiáng)、成功率高;
4、檢測基因組組蛋白修飾、轉(zhuǎn)錄因子、轉(zhuǎn)錄調(diào)控子結(jié)合位點；
5、分析結(jié)果可視化，圖形化的展示peak的富集情況
| 樣本類型 | 建議送樣量 | 存儲介質(zhì) | 保存、運輸條件 |
| 凍存細(xì)胞 | >20 w | 1.將細(xì)胞重懸與凍存液(50% FBS+40%完全培養(yǎng)基+10% DMSO)中,每個凍存管加入≥20萬細(xì)胞 2.將凍存管（標(biāo)記樣本名）放入程序降溫盒中，放入-80度冰箱，降溫6-24H后即可準(zhǔn)備運輸 | -80℃冰箱保存，干冰運輸 |
| 新鮮細(xì)胞 | >10 w | 10%FBS常用培養(yǎng)基 | 運輸時使用碎冰4°運送，新鮮細(xì)胞懸液盡可能在4h內(nèi)送達(dá) |
| 動物組織 | >30 mg | / | 液氮速凍30min 后放于-80℃保存；干冰運輸 |
| 植物 | 葉片≥0.5g；莖≥1 g；根≥1 g | / | 液氮速凍樣本，然后用預(yù)冷的錫箔紙包裹儲存在-80°C，干冰運輸 |
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