產(chǎn)品描述
Illumina Chinese Genotyping Array(CGA芯片) 是一款先進(jìn)的基因分型芯片,由Illumina聯(lián)合微基因(WeGene)等機構(gòu)組成的聯(lián)盟共同設(shè)計,整合中國人群特異性遺傳變異數(shù)據(jù),可為群體規(guī)模遺傳研究、變異篩選和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究提供高價值、可擴展且經(jīng)濟高效的解決方案。
產(chǎn)品優(yōu)勢
1. 針對中國人群優(yōu)化,移除非相關(guān)位點,新增特有變異
2. 廣泛的藥物基因組學(xué)標(biāo)記和外顯子內(nèi)容
3. 廣泛的疾病種類覆蓋
4. 高變異檢出率(>99%)和重現(xiàn)性(>99.9%)
5. 可應(yīng)用于疾病風(fēng)險分析、藥物基因組學(xué)研究、健康和生活方式報告以及復(fù)雜疾病等研究
6. 適用于各種樣本類型:唾液、血液、口腔拭子和FFPE樣本等
位點覆蓋:移除非中國人群冗余位點,新增>70,000個中國人群特有變異位點(未見于公共數(shù)據(jù)庫),顯著提升低頻變異(MAF=1-5%)的檢測能力。
插補精度:基于數(shù)萬例中國樣本的全基因組數(shù)據(jù)優(yōu)化,提高罕見變異插補準(zhǔn)確性,支持大規(guī)模疾病關(guān)聯(lián)研究。
HLA區(qū)域增強:整合10,000例漢族HLA樣本數(shù)據(jù),對>11,000個MHC標(biāo)簽SNP實現(xiàn)>80%的4位/2位HLA等位基因插補精度,助力免疫疾病研究。
全基因組骨架:覆蓋常見與低頻變異,提升全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)的統(tǒng)計效力。
臨床功能性位點:納入多基因風(fēng)險評分(PRS)、藥物基因組學(xué)(如PharmGKB數(shù)據(jù)庫)、癌癥驅(qū)動突變等臨床研究熱點位點。
內(nèi)置QC標(biāo)記:支持樣本追蹤、血統(tǒng)分析和分層研究,確保大規(guī)模隊列研究的可靠性
實驗流程
樣本類型 | 建議送樣量 | 保存、運輸介質(zhì) |
組織 | >50mg | -80℃保存,干冰運輸 |
細(xì)胞 | >2 x 10^6 | -80℃保存,干冰運輸 |
血液 | >1ml | -80℃保存,干冰/4度(新鮮)運輸 |
FFPE | A.切片組織面積大于1cm2,切片表面無劃痕,無干裂,均勻貼片的石蠟切片; B.切片組織細(xì)胞>30000個;有核細(xì)胞比例>80%;腫瘤細(xì)胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,組織面積偏小或細(xì)胞核占比未達(dá)80%以上,需提供5-12片; C.石蠟塊:厚度4mm以上,組織約綠豆大小以上; D.蠟卷:厚度25um左右,2-5卷 | 4℃或常溫保存和運輸 |
唾液 | >1ml,盡量收集較多的細(xì)胞 | 常溫或4℃運輸 |
口腔拭子 | 1.5ml管 2管,或5ml管1管 | 常溫或4℃運輸 |
gDNA | >1ug | -80℃保存,干冰運輸 |
研究方向/思路